Diagnostika, diferenciální diagnostika a léčba plicních chorob. Na klinice je zřízeno Centrum pro intersticiální plicní procesy, které soustřeďuje nemocné s těmito chorobami. Klinika má velmi dobře vybavené Centrum plicní endoskopie, které zajišťuje bronchologické výkony nejen pro celou VFN a jednotku intermediární péče. Dále je zde laboratoř pro vyšetření funkce plic a cytologická laboratoř, které slouží potřebám všech pracovišť VFN.