VFN poskytuje zaměstnancům, kteří nemají trvalé bydliště v Praze, přechodné ubytování ve svých ubytovnách. Ubytovny jsou v dosahu několika minut cesty od nemocnice, jsou koncipovány jako bytové jednotky, které mají dva až tři pokoje, se společnou kuchyňkou, koupelnu a WC. Pokoje jsou jedno a dvoulůžkové.
Ubytování pro zaměstnance VFN je možné na základě platné Smlouvy o přechodném ubytování. V rámci ubytoven je možné poskytnout krátkodobé ubytování i pro externí pracovníky, vykonávající ve VFN odbornou stáž, případně i pro rodinné příslušníky pacientů.